Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef3Q8VCC8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef3Q8VCC8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms