Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc58Q8R3Q6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms