Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Dnaaf4Q8R368 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf4Q8R368 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms