Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E6

V1ra11, Vomeronasal type-1 receptor A11, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra11Q8R2E6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
V1ra11Q8R2E6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
V1ra11Q8R2E6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms