Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CipcQ8R0W1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CipcQ8R0W1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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