Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ7

Tprkb, EKC/KEOPS complex subunit Tprkb, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprkbQ8QZZ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TprkbQ8QZZ7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TprkbQ8QZZ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms