Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
OptnQ8K3K8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms