Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrrtm1Q8K377 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lrrtm1Q8K377 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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