Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcf3Q8K268 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcf3Q8K268 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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