Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkd3Q8K1Y2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms