Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Alkbh3Q8K1E6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Alkbh3Q8K1E6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms