Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
1700001C19RikQ8K168 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms