Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8K039 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8K039 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8K039 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8K039 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8K039 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8K039 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8K039 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8K039 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q8K039 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q8K039 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8K039 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8K039 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8K039 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8K039 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8K039 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8K039 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8K039 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8K039 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q8K039 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8K039 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8K039 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8K039 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8K039 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8K039 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8K039 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8K039 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8K039 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8K039 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8K039 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8K039 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms