Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne5Q8JZW4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpne5Q8JZW4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms