Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rasgef1bQ8JZL7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rasgef1bQ8JZL7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms