Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh4a1Q8CHT0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh4a1Q8CHT0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms