Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1l1Q8CGM2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1l1Q8CGM2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms