Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hpf1Q8CFE2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hpf1Q8CFE2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hpf1Q8CFE2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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