Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp27Q8CEG8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
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Usp27Q8CEG8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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Usp27Q8CEG8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Usp27Q8CEG8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Usp27Q8CEG8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp27Q8CEG8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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