Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl3Q8CD19 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lancl3Q8CD19 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms