Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nhlrc3Q8CCH2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms