Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf21bQ8C966 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf21bQ8C966 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms