Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cwc22Q8C5N3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cwc22Q8C5N3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cwc22Q8C5N3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cwc22Q8C5N3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cwc22Q8C5N3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms