Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc90bQ8C3X2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms