Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vash1Q8C1W1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vash1Q8C1W1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vash1Q8C1W1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vash1Q8C1W1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vash1Q8C1W1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vash1Q8C1W1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vash1Q8C1W1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vash1Q8C1W1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vash1Q8C1W1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vash1Q8C1W1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vash1Q8C1W1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vash1Q8C1W1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Vash1Q8C1W1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Vash1Q8C1W1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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