Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8C1R3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q8C1R3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q8C1R3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q8C1R3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms