Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Iffo1Q8BXL9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Iffo1Q8BXL9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms