Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps13cQ8BX70 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps13cQ8BX70 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms