Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtpaQ8BWP5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms