Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zfp398Q8BV16 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms