Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pggt1bQ8BUY9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms