Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rccd1Q8BTU7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms