Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup54Q8BTS4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms