Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia2Q8BSS9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia2Q8BSS9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms