Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LsampQ8BLK3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LsampQ8BLK3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms