Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp54Q8BL06 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms