Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem87bQ8BKU8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem87bQ8BKU8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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