Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms