Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg4dQ8BGV9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms