Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Best2Q8BGM5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Best2Q8BGM5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms