Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ubash3bQ8BGG7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubash3bQ8BGG7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms