Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms