Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.3Q85ZW6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M10.3Q85ZW6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms