Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4cQ811C2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Atg4cQ811C2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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