Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc50Q810U5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc50Q810U5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms