Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34b3Q80ZS5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms