Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms