Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ClspnQ80YR7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ClspnQ80YR7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms