Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbbp8Q80YR6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp8Q80YR6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp8Q80YR6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbbp8Q80YR6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8Q80YR6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8Q80YR6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8Q80YR6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8Q80YR6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8Q80YR6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8Q80YR6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms