Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Npm2Q80W85 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Npm2Q80W85 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms